備份問題又是企業應該注意的另一個安全問題，既然安全沒有100%，那么文件損壞丟失是不可能完全避免的，而備份是使丟失的文件得以找回的重要措施，所以備份的程度、服務程度和費用都需要考慮一下。

據了解，因用戶原因導致數據丟失的回復，服務商一般會收取一定的費用。

目前，企業郵箱一般都會采用NAS存儲技術。NAS一方面可滿足海量存儲空間的需求，另一方面NAS的冗余功能可以保證數據的有效性，不會造成數據的輕易丟失。

一套完整可靠的企業郵箱備份方案應具備郵件內容完整備份功能，提供多種備份機制，便于隨時審核查詢。郵件記錄模式可按企業規范需求選擇記錄所有進出郵件、部分郵件或指定員工名單郵件。并且可以根據企業的部門結構來設定管理權限，避免越權讀取資料。合理化的備份管理還需將帳號按群組分類，根據不同的需求，設定不同的過濾策略，使郵件管理更符合企業應用。